Ver Gintama 2: Rules are Made to Be Broken Online : En plena época de los samurái, los alienígenas (conocidos como Amanto) invadieron Japón y, pese a la resistencia de varios fieros guerreros Joui, consiguieron tomar el país, llevando a Edo hasta una etapa de esplendor medio futurista. Gintoki Sakata, Shinpachi Shimura y Kagura se quedan sin dinero mientras dirigen su oficina de Yorozuya. No pueden pagar el alquiler y deciden hacer un trabajo a tiempo parcial. Cada vez que van a un trabajo a tiempo parcial, se encuentran con Shogun-sama. Alrededor de ese tiempo, las fuerzas especiales Shinsengumi, lideradas por Isao Kondo se divide entre sí. El conflicto interno de Shinsengumi conecta la conspiración que involucra a Shogun-sama.